4月14日，危地马拉卫生部长雨果•蒙罗伊称美国遣返的移民中，许多人新冠病毒检测呈阳性。他表示3月的一架航班中约75%乘客回国后被确诊，部分移民在登机时就有发烧或其他症状。而此前官方报告被遣返人员中确诊者仅有3人，美国的遣返行动也一度因此暂停，直至13日（周一）才重新开启。危地马拉政府要求每趟航班少于25人，且出发前需对其进行健康检查。但周一两趟航班共载182人，其中还包括16名独行的未成年人。