12月27日，据媒体报道，日本厚生劳动省通报，变异病毒在日本首次出现人传人。住在东京都的一飞行员及其家人被确诊感染英国报告的变异病毒。12月16日，这名男性飞行员从英国返回日本，他作为飞行员不属于机场检疫对象，所以直接返回家中。12月21日，他被检测为新冠病毒阳性。两天后他家中一名无旅行史的女性成员也被确诊感染。